Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gjb4Q02738 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjb4Q02738 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gjb4Q02738 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gjb4Q02738 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjb4Q02738 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjb4Q02738 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms