Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Top2aQ01320 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Top2aQ01320 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms