Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SelpQ01102 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SelpQ01102 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SelpQ01102 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SelpQ01102 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SelpQ01102 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SelpQ01102 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SelpQ01102 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SelpQ01102 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SelpQ01102 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SelpQ01102 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SelpQ01102 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SelpQ01102 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SelpQ01102 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms