Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Grin2bQ01097 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Grin2bQ01097 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Grin2bQ01097 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Grin2bQ01097 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Grin2bQ01097 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Grin2bQ01097 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Grin2bQ01097 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Grin2bQ01097 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Grin2bQ01097 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Grin2bQ01097 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Grin2bQ01097 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Grin2bQ01097 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Grin2bQ01097 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Grin2bQ01097 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Grin2bQ01097 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Grin2bQ01097 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Grin2bQ01097 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Grin2bQ01097 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Grin2bQ01097 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Grin2bQ01097 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Grin2bQ01097 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Grin2bQ01097 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Grin2bQ01097 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Grin2bQ01097 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms