Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbp1Q00915 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbp1Q00915 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 474.6 ms