Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga4Q00651 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms