Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HmmrQ00547 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms