Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GabpaQ00422 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GabpaQ00422 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms