Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms