Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psmb4P99026 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psmb4P99026 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psmb4P99026 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psmb4P99026 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psmb4P99026 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psmb4P99026 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Psmb4P99026 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Psmb4P99026 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psmb4P99026 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb4P99026 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms