Protein–RNA interactions for Protein: P97817

Cdr2, Cerebellar degeneration-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2P97817 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdr2P97817 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdr2P97817 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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