Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IhhP97812 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IhhP97812 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IhhP97812 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IhhP97812 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IhhP97812 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IhhP97812 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IhhP97812 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IhhP97812 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IhhP97812 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IhhP97812 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IhhP97812 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IhhP97812 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IhhP97812 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IhhP97812 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IhhP97812 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IhhP97812 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IhhP97812 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IhhP97812 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IhhP97812 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IhhP97812 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IhhP97812 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IhhP97812 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IhhP97812 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IhhP97812 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IhhP97812 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IhhP97812 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IhhP97812 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IhhP97812 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IhhP97812 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IhhP97812 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IhhP97812 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IhhP97812 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IhhP97812 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IhhP97812 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IhhP97812 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IhhP97812 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IhhP97812 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IhhP97812 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IhhP97812 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IhhP97812 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IhhP97812 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IhhP97812 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IhhP97812 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IhhP97812 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IhhP97812 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IhhP97812 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IhhP97812 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IhhP97812 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IhhP97812 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IhhP97812 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IhhP97812 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IhhP97812 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IhhP97812 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IhhP97812 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IhhP97812 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IhhP97812 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IhhP97812 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IhhP97812 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IhhP97812 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IhhP97812 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IhhP97812 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IhhP97812 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IhhP97812 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IhhP97812 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IhhP97812 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IhhP97812 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IhhP97812 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IhhP97812 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IhhP97812 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IhhP97812 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IhhP97812 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IhhP97812 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IhhP97812 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IhhP97812 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IhhP97812 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IhhP97812 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IhhP97812 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IhhP97812 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IhhP97812 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IhhP97812 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IhhP97812 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IhhP97812 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IhhP97812 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IhhP97812 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IhhP97812 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IhhP97812 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IhhP97812 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IhhP97812 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IhhP97812 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IhhP97812 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IhhP97812 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IhhP97812 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IhhP97812 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IhhP97812 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IhhP97812 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IhhP97812 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IhhP97812 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IhhP97812 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IhhP97812 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms