Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr2cP97760 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Polr2cP97760 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Polr2cP97760 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms