Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smyd1P97443 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms