Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nbr1P97432 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms