Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps45P97390 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps45P97390 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps45P97390 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps45P97390 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps45P97390 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps45P97390 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps45P97390 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vps45P97390 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vps45P97390 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps45P97390 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vps45P97390 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps45P97390 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vps45P97390 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps45P97390 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps45P97390 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps45P97390 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps45P97390 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vps45P97390 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps45P97390 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps45P97390 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps45P97390 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps45P97390 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps45P97390 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps45P97390 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps45P97390 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vps45P97390 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps45P97390 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps45P97390 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps45P97390 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Vps45P97390 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps45P97390 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps45P97390 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps45P97390 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vps45P97390 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps45P97390 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Vps45P97390 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps45P97390 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps45P97390 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vps45P97390 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps45P97390 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps45P97390 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps45P97390 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vps45P97390 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vps45P97390 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps45P97390 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps45P97390 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps45P97390 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps45P97390 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps45P97390 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps45P97390 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps45P97390 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps45P97390 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps45P97390 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps45P97390 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vps45P97390 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps45P97390 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps45P97390 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Vps45P97390 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps45P97390 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vps45P97390 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vps45P97390 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vps45P97390 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vps45P97390 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vps45P97390 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps45P97390 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps45P97390 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps45P97390 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps45P97390 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps45P97390 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps45P97390 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps45P97390 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps45P97390 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps45P97390 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps45P97390 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps45P97390 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps45P97390 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps45P97390 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps45P97390 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms