Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RhodP97348 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhodP97348 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhodP97348 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhodP97348 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhodP97348 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhodP97348 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhodP97348 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhodP97348 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhodP97348 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhodP97348 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhodP97348 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhodP97348 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhodP97348 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhodP97348 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhodP97348 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RhodP97348 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RhodP97348 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhodP97348 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhodP97348 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RhodP97348 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhodP97348 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhodP97348 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhodP97348 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhodP97348 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhodP97348 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhodP97348 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhodP97348 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhodP97348 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhodP97348 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhodP97348 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhodP97348 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhodP97348 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhodP97348 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhodP97348 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhodP97348 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhodP97348 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhodP97348 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhodP97348 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhodP97348 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhodP97348 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhodP97348 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhodP97348 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhodP97348 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RhodP97348 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RhodP97348 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhodP97348 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhodP97348 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RhodP97348 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhodP97348 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhodP97348 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhodP97348 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhodP97348 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhodP97348 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhodP97348 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhodP97348 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhodP97348 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhodP97348 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RhodP97348 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhodP97348 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhodP97348 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhodP97348 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhodP97348 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhodP97348 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhodP97348 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhodP97348 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhodP97348 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhodP97348 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhodP97348 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhodP97348 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhodP97348 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhodP97348 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhodP97348 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhodP97348 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhodP97348 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhodP97348 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RhodP97348 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RhodP97348 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhodP97348 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhodP97348 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhodP97348 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhodP97348 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhodP97348 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhodP97348 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhodP97348 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhodP97348 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhodP97348 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhodP97348 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhodP97348 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhodP97348 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhodP97348 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhodP97348 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhodP97348 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhodP97348 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhodP97348 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhodP97348 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhodP97348 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhodP97348 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhodP97348 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhodP97348 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms