Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
H3f3aP84244 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms