Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Otx2P80206 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otx2P80206 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otx2P80206 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otx2P80206 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otx2P80206 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx2P80206 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx2P80206 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otx2P80206 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otx2P80206 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otx2P80206 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otx2P80206 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otx2P80206 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otx2P80206 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otx2P80206 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms