Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otx1P80205 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otx1P80205 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otx1P80205 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx1P80205 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx1P80205 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otx1P80205 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otx1P80205 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otx1P80205 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms