Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tp53bp1P70399 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms