Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Shox2P70390 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shox2P70390 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Shox2P70390 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shox2P70390 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shox2P70390 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shox2P70390 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shox2P70390 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Shox2P70390 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shox2P70390 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shox2P70390 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shox2P70390 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shox2P70390 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shox2P70390 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shox2P70390 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shox2P70390 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shox2P70390 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shox2P70390 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shox2P70390 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shox2P70390 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shox2P70390 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shox2P70390 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Shox2P70390 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shox2P70390 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shox2P70390 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shox2P70390 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shox2P70390 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shox2P70390 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shox2P70390 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shox2P70390 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shox2P70390 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shox2P70390 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shox2P70390 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shox2P70390 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shox2P70390 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shox2P70390 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shox2P70390 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shox2P70390 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shox2P70390 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shox2P70390 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shox2P70390 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shox2P70390 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shox2P70390 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shox2P70390 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shox2P70390 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shox2P70390 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shox2P70390 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms