Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ufd1P70362 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms