Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad1P70340 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smad1P70340 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Smad1P70340 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad1P70340 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms