Protein–RNA interactions for Protein: P70324

Tbx3, T-box transcription factor TBX3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx3P70324 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbx3P70324 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbx3P70324 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbx3P70324 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbx3P70324 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbx3P70324 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms