Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb13P70321 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxb13P70321 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxb13P70321 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxb13P70321 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb13P70321 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb13P70321 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb13P70321 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb13P70321 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb13P70321 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb13P70321 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb13P70321 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb13P70321 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb13P70321 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb13P70321 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms