Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sycp3P70281 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sycp3P70281 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sycp3P70281 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sycp3P70281 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sycp3P70281 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sycp3P70281 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sycp3P70281 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sycp3P70281 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sycp3P70281 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sycp3P70281 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sycp3P70281 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sycp3P70281 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sycp3P70281 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sycp3P70281 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sycp3P70281 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp3P70281 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp3P70281 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp3P70281 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp3P70281 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp3P70281 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp3P70281 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp3P70281 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp3P70281 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp3P70281 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sycp3P70281 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sycp3P70281 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sycp3P70281 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sycp3P70281 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sycp3P70281 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sycp3P70281 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sycp3P70281 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sycp3P70281 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sycp3P70281 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sycp3P70281 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sycp3P70281 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sycp3P70281 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sycp3P70281 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sycp3P70281 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sycp3P70281 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sycp3P70281 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sycp3P70281 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sycp3P70281 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sycp3P70281 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms