Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Surf6P70279 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Surf6P70279 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Surf6P70279 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Surf6P70279 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Surf6P70279 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Surf6P70279 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf6P70279 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf6P70279 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Surf6P70279 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf6P70279 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf6P70279 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf6P70279 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf6P70279 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf6P70279 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf6P70279 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Surf6P70279 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Surf6P70279 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Surf6P70279 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Surf6P70279 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Surf6P70279 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Surf6P70279 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Surf6P70279 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Surf6P70279 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Surf6P70279 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Surf6P70279 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Surf6P70279 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Surf6P70279 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Surf6P70279 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Surf6P70279 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Surf6P70279 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Surf6P70279 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Surf6P70279 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Surf6P70279 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Surf6P70279 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Surf6P70279 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Surf6P70279 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Surf6P70279 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Surf6P70279 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Surf6P70279 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Surf6P70279 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Surf6P70279 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Surf6P70279 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Surf6P70279 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Surf6P70279 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Surf6P70279 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Surf6P70279 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Surf6P70279 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Surf6P70279 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Surf6P70279 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Surf6P70279 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Surf6P70279 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Surf6P70279 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Surf6P70279 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Surf6P70279 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Surf6P70279 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Surf6P70279 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Surf6P70279 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Surf6P70279 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Surf6P70279 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Surf6P70279 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Surf6P70279 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Surf6P70279 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Surf6P70279 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Surf6P70279 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Surf6P70279 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms