Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stra8P70278 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stra8P70278 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stra8P70278 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stra8P70278 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Stra8P70278 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stra8P70278 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stra8P70278 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Stra8P70278 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stra8P70278 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stra8P70278 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stra8P70278 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms