Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkn1P70268 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms