Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NficP70255 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NficP70255 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NficP70255 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NficP70255 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NficP70255 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NficP70255 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NficP70255 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NficP70255 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NficP70255 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NficP70255 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NficP70255 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NficP70255 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NficP70255 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NficP70255 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NficP70255 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NficP70255 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NficP70255 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NficP70255 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NficP70255 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NficP70255 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NficP70255 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NficP70255 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NficP70255 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NficP70255 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NficP70255 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NficP70255 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NficP70255 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NficP70255 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NficP70255 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NficP70255 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NficP70255 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NficP70255 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NficP70255 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NficP70255 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NficP70255 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NficP70255 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NficP70255 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NficP70255 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NficP70255 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NficP70255 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NficP70255 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NficP70255 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NficP70255 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NficP70255 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NficP70255 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NficP70255 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NficP70255 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NficP70255 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NficP70255 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NficP70255 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NficP70255 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NficP70255 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NficP70255 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NficP70255 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NficP70255 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NficP70255 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NficP70255 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NficP70255 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NficP70255 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NficP70255 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NficP70255 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NficP70255 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NficP70255 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NficP70255 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NficP70255 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NficP70255 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NficP70255 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NficP70255 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NficP70255 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NficP70255 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NficP70255 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NficP70255 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NficP70255 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NficP70255 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NficP70255 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NficP70255 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NficP70255 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NficP70255 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NficP70255 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NficP70255 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NficP70255 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NficP70255 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NficP70255 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NficP70255 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NficP70255 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NficP70255 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NficP70255 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NficP70255 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NficP70255 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NficP70255 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NficP70255 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NficP70255 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NficP70255 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NficP70255 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NficP70255 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NficP70255 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NficP70255 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NficP70255 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NficP70255 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms