Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chl1P70232 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chl1P70232 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chl1P70232 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Chl1P70232 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chl1P70232 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chl1P70232 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chl1P70232 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chl1P70232 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chl1P70232 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chl1P70232 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Chl1P70232 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chl1P70232 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Chl1P70232 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.7 ms