Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DccP70211 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DccP70211 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DccP70211 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DccP70211 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DccP70211 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DccP70211 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DccP70211 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DccP70211 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DccP70211 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DccP70211 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DccP70211 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DccP70211 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DccP70211 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DccP70211 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DccP70211 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DccP70211 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DccP70211 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DccP70211 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DccP70211 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DccP70211 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DccP70211 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DccP70211 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DccP70211 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DccP70211 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DccP70211 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DccP70211 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DccP70211 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DccP70211 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DccP70211 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DccP70211 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DccP70211 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DccP70211 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DccP70211 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DccP70211 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DccP70211 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DccP70211 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DccP70211 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DccP70211 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
DccP70211 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DccP70211 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DccP70211 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DccP70211 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DccP70211 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DccP70211 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DccP70211 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DccP70211 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DccP70211 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DccP70211 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DccP70211 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DccP70211 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DccP70211 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DccP70211 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DccP70211 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DccP70211 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DccP70211 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DccP70211 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DccP70211 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DccP70211 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DccP70211 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DccP70211 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DccP70211 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DccP70211 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DccP70211 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DccP70211 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DccP70211 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DccP70211 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DccP70211 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DccP70211 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DccP70211 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DccP70211 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DccP70211 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DccP70211 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DccP70211 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DccP70211 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DccP70211 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DccP70211 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DccP70211 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DccP70211 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DccP70211 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DccP70211 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
DccP70211 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DccP70211 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DccP70211 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DccP70211 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DccP70211 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DccP70211 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DccP70211 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DccP70211 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DccP70211 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DccP70211 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DccP70211 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DccP70211 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DccP70211 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DccP70211 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DccP70211 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DccP70211 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DccP70211 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DccP70211 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DccP70211 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms