Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf5P70191 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf5P70191 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf5P70191 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf5P70191 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf5P70191 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf5P70191 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf5P70191 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf5P70191 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf5P70191 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf5P70191 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf5P70191 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf5P70191 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf5P70191 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf5P70191 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf5P70191 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf5P70191 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf5P70191 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms