Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps17P63276 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps17P63276 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps17P63276 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps17P63276 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps17P63276 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps17P63276 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps17P63276 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps17P63276 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps17P63276 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps17P63276 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps17P63276 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps17P63276 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps17P63276 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps17P63276 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps17P63276 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps17P63276 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps17P63276 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps17P63276 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps17P63276 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps17P63276 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms