Protein–RNA interactions for Protein: P63137

Gabrb2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb2P63137 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabrb2P63137 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabrb2P63137 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gabrb2P63137 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gabrb2P63137 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabrb2P63137 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabrb2P63137 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabrb2P63137 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabrb2P63137 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabrb2P63137 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabrb2P63137 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms