Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx1P63013 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrx1P63013 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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