Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gnb1P62874 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms