Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms