Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tbpl1P62340 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tbpl1P62340 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbpl1P62340 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbpl1P62340 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbpl1P62340 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbpl1P62340 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbpl1P62340 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbpl1P62340 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbpl1P62340 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbpl1P62340 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbpl1P62340 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbpl1P62340 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbpl1P62340 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbpl1P62340 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbpl1P62340 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbpl1P62340 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tbpl1P62340 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tbpl1P62340 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tbpl1P62340 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms