Protein–RNA interactions for Protein: P62334

Psmc6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc6P62334 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Psmc6P62334 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Psmc6P62334 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmc6P62334 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms