Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf6P62331 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf6P62331 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf6P62331 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf6P62331 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf6P62331 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf6P62331 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf6P62331 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf6P62331 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf6P62331 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf6P62331 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf6P62331 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf6P62331 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arf6P62331 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arf6P62331 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arf6P62331 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arf6P62331 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arf6P62331 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arf6P62331 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arf6P62331 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf6P62331 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf6P62331 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf6P62331 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf6P62331 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arf6P62331 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf6P62331 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf6P62331 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arf6P62331 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms