Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps29P62274 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps29P62274 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps29P62274 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps29P62274 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps29P62274 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps29P62274 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps29P62274 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps29P62274 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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