Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copz1P61924 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copz1P61924 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copz1P61924 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copz1P61924 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copz1P61924 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms