Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx1bP61264 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Stx1bP61264 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Stx1bP61264 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx1bP61264 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx1bP61264 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms