Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abce1P61222 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abce1P61222 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abce1P61222 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abce1P61222 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abce1P61222 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abce1P61222 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abce1P61222 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abce1P61222 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms