Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf13P61216 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf13P61216 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf13P61216 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf13P61216 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf13P61216 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms