Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfia3P60469 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms