Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rin3P59729 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rin3P59729 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rin3P59729 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rin3P59729 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rin3P59729 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rin3P59729 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rin3P59729 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rin3P59729 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rin3P59729 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rin3P59729 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rin3P59729 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rin3P59729 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rin3P59729 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rin3P59729 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rin3P59729 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rin3P59729 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rin3P59729 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rin3P59729 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rin3P59729 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rin3P59729 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rin3P59729 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rin3P59729 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rin3P59729 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rin3P59729 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rin3P59729 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rin3P59729 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rin3P59729 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rin3P59729 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rin3P59729 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rin3P59729 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rin3P59729 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rin3P59729 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rin3P59729 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rin3P59729 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rin3P59729 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rin3P59729 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rin3P59729 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rin3P59729 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rin3P59729 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rin3P59729 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rin3P59729 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rin3P59729 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rin3P59729 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rin3P59729 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rin3P59729 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rin3P59729 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rin3P59729 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rin3P59729 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rin3P59729 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rin3P59729 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rin3P59729 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rin3P59729 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rin3P59729 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rin3P59729 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms