Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup43P59235 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup43P59235 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nup43P59235 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nup43P59235 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nup43P59235 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nup43P59235 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nup43P59235 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nup43P59235 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nup43P59235 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nup43P59235 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nup43P59235 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms